马耳他位于南欧，意大利西西里岛南方90公里的地中海上中部。有“地中海心脏”之称，面积316平方公里，是闻名世界的旅游胜地，被誉为“欧洲的乡村”。全国由马耳他岛、戈佐、科米诺（即凯穆纳岛，面积约3平方公里）、科米诺托和菲尔夫拉岛五个小岛组成，其中马耳他岛面积最大，为245平方公里。海岸线长180公里。马耳他岛地势西高东低，丘陵起伏，间有小块盆地，无森林、河流或湖泊，缺淡水。

马耳他属亚热带地中海式气候。夏季平均温度为25℃，冬季平均气温为15℃，平均气温21.3℃，最高气温40℃，最低气温5℃。年平均降水量560毫米。11月至次年的3月为冬雨季。

马耳他最大的天然良港――大港位于首都瓦莱塔与比尔古、圣格莱亚和考斯皮卡三座古城之间，港区海岸线长15.56公里，万吨货轮可进港装卸货物，年吞吐量为160万吨。港内有多处深水码头以及装卸、加油和储粮等设施。